Một nghiên cứu metagenomic gần đây đã tiết lộ một phổ vi rút và vi khuẩn đa dạng đáng kể được mang bởi các loài gặm nhấm ở tỉnh Hắc Long Giang, bao gồm vi rút Lassa, vi rút Amur, Salmonella và Yersinia pestis.
Nghiên cứu đã sử dụngBộ dụng cụ làm giàu RNA mầm bệnh từ Macro & Micro-TestPhương pháp này dựa trên công nghệ thu giữ bằng đầu dò. Bằng cách loại bỏ có chọn lọc rRNA của vật chủ và các đoạn vật chủ được bảo tồn khác, phương pháp này giữ lại hiệu quả RNA vi sinh vật, cải thiện đáng kể độ nhạy phát hiện mầm bệnh. Bước làm giàu RNA mầm bệnh này rất quan trọng để đạt được tỷ lệ phát hiện cao và cung cấp hỗ trợ kỹ thuật mạnh mẽ cho việc giám sát mầm bệnh.
Loài gặm nhấm: Nguồn lây truyền chính của các bệnh truyền nhiễm từ động vật sang người
Loài gặm nhấm là nhóm động vật có vú đa dạng loài nhất và phân bố rộng rãi nhất, bao gồm hơn 2.000 loài trên toàn thế giới và chiếm hơn 40% tổng số loài động vật có vú.
Ngoài tầm quan trọng về mặt sinh thái, loài gặm nhấm còn là vật chủ và vật trung gian truyền bệnh của nhiều mầm bệnh lây truyền từ động vật sang người.Do môi trường sống của loài gặm nhấm thường trùng lặp với môi trường sống của con người—thông qua vết cắn trực tiếp, tiếp xúc với chất thải hoặc lây truyền gián tiếp qua bọ chét và ve—nên các mầm bệnh mà chúng mang theo gây ra mối đe dọa dai dẳng đối với sức khỏe cộng đồng.
Đáng chú ý, hơn 70% các bệnh truyền nhiễm mới nổi có nguồn gốc từ động vật hoang dã, trong đó loài gặm nhấm là một trong những ổ chứa virus quan trọng nhất.
Khu vực biên giới Hắc Long Giang: Tuyến đầu trong công tác giám sát mầm bệnh
Hắc Long Giang, một tỉnh biên giới ở phía đông bắc Trung Quốc, sở hữu nguồn tài nguyên sinh thái phong phú và giáp biên giới với nhiều quốc gia. Sự kết hợp giữa đa dạng sinh học phong phú và sự di chuyển dân cư thường xuyên qua biên giới tạo điều kiện thuận lợi cho sự lây lan mầm bệnh.
Từ tháng 6 đến tháng 7 năm 2021, các nhà nghiên cứu đã thu thập 67 cá thể gặm nhấm hoang dã từ thị trấn Hengdaohezi, thành phố Mudanjiang. Các mẫu vật bao gồm:
l 20Apodemus peninsulae
l 47Myodes rufocanus
Tất cả các mẫu vật đều được thu thập tại các khu dân cư và vùng đất nông nghiệp xung quanh, cho thấy mối liên hệ mật thiết giữa khu dân cư và môi trường sống của động vật hoang dã.
Công nghệ làm giàu mầm bệnh: Khắc phục sự can thiệp từ nền tảng vật chủ
Trong giải trình tự metagenomic, RNA của vật chủ thường chiếm ưu thế trong các trình tự đọc, che khuất các tín hiệu mầm bệnh có số lượng thấp.
Để giải quyết thách thức này, nghiên cứu đã sử dụngBộ dụng cụ phát hiện metagenomic mầm bệnh của Macro & Micro-Test. Sử dụng công nghệ bắt giữ bằng đầu dò, các đầu dò được thiết kế đặc biệt sẽ liên kết với rRNA của vật chủ và các trình tự được bảo tồn, cho phép loại bỏ chúng và do đó làm giàu RNA của vi sinh vật.
Phương pháp này đã cải thiện đáng kể độ nhạy phát hiện mầm bệnh, cho phép quá trình giải trình tự tiếp theo thu hồi được tỷ lệ trình tự mầm bệnh cao hơn. Bước làm giàu đã tạo nền tảng vững chắc để mô tả chính xác phổ mầm bệnh mà loài gặm nhấm mang theo.
Sau quá trình làm giàu, các mẫu RNA trải qua quá trình phiên mã ngược, xây dựng thư viện và giải trình tự tốc độ cao. Phân tích tin sinh học bao gồm:
Lọc bộ gen vật chủ
Phân loại học bằng Kraken2
l Hiệu chỉnh độ phong phú bằng Bracken
Quy trình này đã tạo ra một hồ sơ toàn diện về cộng đồng vi rút và vi khuẩn.
Kết quả nghiên cứu: Sự lưu hành đồng thời của nhiều loại virus và vi khuẩn.
Phát hiện về virus
Các virus được phát hiện thuộc 21 họ virus, bao gồm:Họ ArenaviridaeVàHọ Hantaviridae.
Bởi vìmớiSau khi lắp ráp bằng Megahit, 154 đoạn trình tự virus đã được tạo ra, trong đó 110 đoạn khớp với 19 virus từ tám họ.
In Apodemus peninsulaeCác loại virus sau đây đã được xác định:
l Arenaviruses: Virus Lassa, virus Ôn Châu, virus Gairo
l Hantavirus: Virus Amur, virus Puumala
In Myodes rufocanusVirus gây bệnh động mạch ở chuột và virus Amur đã được phát hiện.
Trong số các tác nhân gây bệnh này có:
Virus Lassa là tác nhân gây bệnh sốt xuất huyết do virus, với tỷ lệ tử vong lên tới khoảng 20%.
Virus Hantavirus là một trong những tác nhân gây bệnh sốt xuất huyết kèm hội chứng thận (HFRS). Trung Quốc báo cáo gánh nặng nhiễm hantavirus cao nhất toàn cầu.
Kết quả nghiên cứu vi khuẩn
Tổng cộng có 1.051 chi vi khuẩn đã được ghi chú.
Các chi phổ biến nhất là:
lVi khuẩn Salmonella(26–31%)
lYersinia(11–23%)
Vi khuẩn SalmonellaĐây là một tác nhân gây bệnh chính lây truyền qua thực phẩm, chịu trách nhiệm cho khoảng 9 triệu trường hợp sốt thương hàn và khoảng 110.000 ca tử vong mỗi năm trên toàn thế giới.
Yersinia pestisVi rút I-bacter bacterium argan, tác nhân gây bệnh dịch hạch, đã gây ra ba đại dịch lịch sử. Tỉnh Hắc Long Giang được công nhận là một trong những ổ dịch hạch tự nhiên của Trung Quốc và vẫn là khu vực ưu tiên trong công tác giám sát dịch hạch.
Ý nghĩa của nghiên cứu
Đóng góp khoa học
Nghiên cứu này là báo cáo đầu tiên về các mảnh virus Lassa và virus viêm động mạch chuột ở loài gặm nhấm tại Hắc Long Giang, góp phần mở rộng cơ sở dữ liệu về mầm bệnh lây truyền từ động vật gặm nhấm ở Trung Quốc.
Nó mô tả một cách có hệ thống các cộng đồng virus và vi khuẩn trong quần thể động vật gặm nhấm địa phương, cung cấp dữ liệu cơ bản cho việc giám sát bệnh truyền nhiễm từ động vật sang người ở các vùng biên giới.
Ý nghĩa đối với sức khỏe cộng đồng
Các phát hiện này nhấn mạnh sự cần thiết phải giám sát liên tục và sàng lọc mầm bệnh.A. bán đảoVàM. rufocanus.
Dữ liệu này cung cấp bằng chứng khoa học hỗ trợ các chiến lược kiểm soát nguồn lây bệnh đối với các bệnh như dịch hạch và sốt xuất huyết kèm hội chứng thận.
Điểm mạnh về phương pháp luận
Giải trình tự metagenomic cho phép phát hiện không thiên vị cả các tác nhân gây bệnh đã biết và mới.
Trong nghiên cứu này, công nghệ làm giàu mầm bệnh của Macro & Micro-Test đã chứng minh hiệu quả mạnh mẽ, giúp tăng cường khả năng phát hiện mầm bệnh mục tiêu trong các mẫu sinh học phức tạp. Kết quả khẳng định khả năng hỗ trợ nhận dạng mầm bệnh với độ nhạy cao trong giám sát động vật hoang dã.
Đề xuất sản phẩm
Dựa trên ứng dụng thành công trong nghiên cứu này, Bộ dụng cụ làm giàu RNA mầm bệnh Macro & Micro-Test được đánh giá cao và khuyến nghị sử dụng trong nghiên cứu giám sát metagenomic.
Bằng cách loại bỏ hiệu quả axit nucleic của vật chủ và làm giàu trình tự vi sinh vật, bộ kit này cải thiện đáng kể độ nhạy phát hiện và chất lượng dữ liệu. Nó là một công cụ thiết yếu để phát hiện mầm bệnh chính xác trong các mẫu phức tạp và cung cấp hỗ trợ kỹ thuật mạnh mẽ cho giám sát sức khỏe cộng đồng, đánh giá rủi ro lây truyền từ động vật sang người và chuẩn bị ứng phó với dịch bệnh.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Thời gian đăng bài: 02/03/2026